Попробуйте обновить или переустановить навигатор. На сколько мне известно да, карты можно скачивать на любой доступный носитель, в настройках можно выбрать память, куда они будут сохраняться.

Но до сих пор не могу понять,  для чего качать эти карты, когда без интернета он не может проложить путь даже в черте города:)

В прошлом году качал карты что бы доехать в оффлайн до краснодара, все области которые входили в маршрут. В итоге поехал с навителом.

Очень часто разрабам задают этот вопрос, но они больше заняты москвой и поиском парковки.

Просто в моей магнитоле сам Яндекс навигатор  не видит SD карту , он видит только оставшееся место от 16 гб, То есть основной раздел 8 гб и остаток, а вставленную на 32гига карту не видит.